主要的严重不良反应为严重的骨髓抑制和心脏毒性。骨髓抑制主要表现为白细胞、红细胞、血小板减少；心脏毒性表现为致命性充血性心力衰竭、急性心律失常及心肌病。其他不良反应有：脱发，绝大多数病人为可逆性；急性恶心和呕吐；粘膜炎，通常主要是口腔粘膜炎，出现于开始治疗后3-10天；食管炎和腹泻；发热，寒战，皮疹；肝脏酶类和胆红素增高的发生率为20-30%；单独使用本品或与阿糖胞苷合用会产生严重的，有时甚至是致命的感染。使用本品1-2天后，尿出现红染，应告知患者无须惊慌。